Su misión es la de definir, sobre la base de la más sólida evidencia existente, los estándares de calidad exigibles a las intervenciones sanitarias dirigidas a problemas de salud prioritarios. Además, se busca contribuir a sustentar las decisiones políticas ministeriales en el análisis de la información relevante acerca de evidencia científica y características del entorno en que se desarrolla dicho proceso de definición de políticas.

Los objetivos principales de esta división son:

• Aportar evidencia para la definición de prioridades en materia de problemas de salud a integrar en el régimen garantizado e intervenciones adecuadas para su enfrentamiento.
• Definir estándares de calidad para el desarrollo de programas de salud apuntados a prioridades sanitarias reflejadas en los objetivos sanitarios de la década.
• Contribuir a la mejoría continua de la gestión y la efectividad de la acción de las autoridades sanitarias regionales.
• Mejorar las relaciones de colaboración mutua al interior de la división y en sus relaciones con el resto de las dependencias ministeriales, promoviendo un estilo de trabajo responsable, cooperativo, interdisciplinario y fraterno.

Los departamentos que conforman esta división son: