La División de Finanzas y Administración Interna tiene una dotación de 156 funcionarios, entre contratados, titulares y honorarios. Esta División depende administrativamente de la Subsecretaría de Salud Pública, no obstante tiene como clientes a la Subsecretaría de Salud Pública y Subsecretaría de Redes Asistenciales. Por otra parte, presta servicios de soporte a distintos usuarios internos (divisiones, gabinetes y Secretarías Regionales de Salud) y externos (DIPRES-Ministerio de Hacienda, Contraloría General de la República, Superintendencia de Seguridad Social, Tesorería General de la República, Servicios de Salud, ISP, Fonasa, Cenabast, Congreso, entre otros).

El objetivo general de esta división es gestionar el uso eficiente de los recursos físicos y financieros para el adecuado funcionamiento institucional, entregando soporte en estas áreas a las Autoridades Institucionales, usuarios internos y externos,  para contribuir a la oportuna provisión de los productos estratégicos a la ciudadanía.

Los objetivos específicos que le corresponde son:

• Fortalecer la gestión administrativa, presupuestaria y financiera de ambas Subsecretarías para la adecuada ejecución de las políticas, planes y programas de salud.
• Ordenamiento y mejoramiento de todos aquellos procesos vulnerables, críticos y complejos en materias de recursos humanos, administración y finanzas. Se persigue realizar procesos de calidad y oportunos,  respetando la normativa vigente.
• Proveer oportunamente el recurso humano con las competencias necesarias a través de sus procesos de reclutamiento, selección, contratación, inducción y pertenencia del personal al Ministerio de Salud.
• Entregar información oportuna y confiable para la adecuada toma de decisiones institucionales.

Los departamentos que conforman esta división son: